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如今培養基種類繁多，它能夠按成分、物理狀況、用處等方面來區別，依照用處能夠分為根底培養基、鑒別培養基、養分培養基、挑選培養基四大類。
一、鑒別培養基
是一類含有某種特定化合物或試劑的培養基。某種微生物在這種培養基上培育后，它所產生的某種代謝產物與這種特定的化合物或試劑能發生某種明顯的特征性反應，依據這一特征性反應能夠將某種微生物與其他中微生物區別開來。主要用于不同類型微生物的快速鑒定，如用來查看細菌能否產生硫化氫的醋酸鉛培養基。
二、根底培養基
含有一般細菌成長繁殖需求的基本的養分物質。常用的根底培養基是上面提及的天然培養基中的牛肉膏蛋白胨培養基。這種培養基可作為一些特別培養基的根底成分。
三、養分培養基（加富培養基）
在根底培養基中參加某些特別養分物質，如血液、血清、酵母浸膏或成長因子等。用以培育對養分要求高的微生物，如培育百日咳桿菌需求含有血液的培養基。
四、挑選培養基
利用微生物對某種或某些化學物質的敏感性不同，在培養基中參加這類物質，按捺不需求的微生物成長。
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