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文章分享 | Ribo-seq與RNA-seq聯合分析揭示uAUG-ds翻譯調控機制2024/6/14

技術簡介RNA-seq主要從轉錄組水平分析基因的表達調控機制，檢測用于核糖體翻譯的RNA序列及二級結構。Ribo-seq主要用于檢測核糖體翻譯的起始位置、翻譯富集區和翻譯終止位置。RNA-seq與Ri...

文章分享 | 基于翻譯組學技術揭示小麥籽粒發育過程中的翻譯調控機制2024/6/6

2023年發表在ThePlantCell上的“Thetranslationallandscapeofbreadwheatduringgraindevelopment”文章，發現了上游開放閱讀框（uOR...

楊樹miRNA在調控楊樹抗旱中的分子機制2024/5/28

2024年3月6日，林木遺傳育種全國重點實驗室、北京林業大學生物科學與技術學院尹偉倫與夏新莉教授課題組在NewPhytologist（中科院一區，影響因子9.4）期刊發表了題為“ThemiR6445-...

EMSA助力揭示楊樹扦插生根中LBD16介導通路的保守性2024/5/17

2023年6月15日，北京林業大學林金星研究組、李曉娟研究組，中國科學院徐麟研究組聯合在TheInnovationLife期刊上在線發表了題為“Transcriptomeframeworkofroot...

DAP-seq助力揭示GhRCD1促進棉花對鎘的耐受調節機制2024/4/29

鎘（Cd2+）是環境中最常見的有害重金屬之一，嚴重威脅作物生產力和質量以及食品安全。Cd2+容易被植物從土壤中吸收，并通過可食用的植物器官和谷物進入食物鏈，對食品質量、糧食安全和公共安全構成威脅。植物...

DAP-seq助力揭示轉錄因子在草地貪夜蛾Bt抗性中重要作用2024/4/25

2024年4月6日，武漢生物工程學院生命科學與技術學院劉磊磊課題組在InternationalJournalofBiologicalMacromolecules（中科院一區，影響因子8.2）期刊在線發...

DAP-seq與RNA-seq聯合分析助力揭示AvERF73參與調控低氧應答和甲羥戊酸途徑2024/4/24

澇害（Waterlogging）是長期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時排除，積水深度過大，時間過長，造成作物根部氧氣不足，并產生乙醇等有毒有害物質，從而影響作物生長，甚至造成作物死亡，造成...

文章分享：應用Ribo-seq技術量化tRNA對乳腺癌細胞轉移的調控2024/4/10

技術簡介Ribo-seq，又稱為RibosomeProfiling或者翻譯組測序，能夠對與核糖體結合并正在被翻譯的約30nt的mRNA片段進行測序，詳細檢測體內的翻譯狀態，Ribo-seq是連接轉錄組...

Ribo-seq：檢測正在翻譯的mRNA信息，連接轉錄組學與蛋白質組學的橋梁2024/3/5

技術原理蛋白質是生命活動的主要承擔者,翻譯調控又是細胞內重要的調控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導蛋白質合成的過程,是基因表達的關鍵步驟。翻譯的過程受到嚴格的調控,很多疾病與翻譯異常相關,比如...

DAP-seq鑒定BcERF070下游靶基因，揭示乙烯調控小白菜開花機制2024/2/22

不結球白菜（Pak-choi），俗稱小白菜，是一種原產于中國的多葉狀蔬菜，已逐漸在世界范圍內種植。小白菜易于早熟的特性，限制了生長發育和產量積累。因此，了解小白菜的開花調控機制對育種和產業具有重要意義...

DNA pull down技術助力揭示AP2/ERF類轉錄因子提高芍藥耐高溫能力的分子機制2024/1/31

芍藥是一種傳統的中藥材，并且具有欣賞價值，其生長發育經常受到高溫脅迫的影響。褪黑素是一種內源性微分子吲哚胺化合物，在各種生物體中具有多種生理功能，大量研究表明調節與褪黑素生物合成相關的基因來提高植物對...

應用HaloTag pull-down技術鑒定了與胡楊CPK21互作的重金屬脅迫相關蛋白2024/1/29

鎘(Cd)污染因其毒性在全球范圍內造成了嚴重的生態問題，重金屬對植物造成的傷害除了離子毒害效應，還會影響植物的水分狀況，造成植物生理干旱。當前，干旱也已成為全球農林業生產和發展的重大威脅。胡楊（Pop...

轉錄因子PpNAC1和DNA去甲基酶PpDML1協同調控桃果實成熟2024/1/22

2023年11月22日，浙江大學張波教授課題組研究成果，發表在PlantPhysiology期刊上（影響因子7.4），文章題目為TranscriptionfactorPpNAC1ａndDNAdemet...

DAP-seq技術助力揭示MdBPC2轉錄因子調控生長素的合成從而調控蘋果性狀2024/1/15

植物生長素（IAA）在植物生長發育過程中起著重要的作用。其化學本質是吲哚乙酸。主要作用是使植物細胞壁松弛，從而使細胞生長伸長，在許多植物中還能增加RNA和蛋白質的合成。目前BARLEYBRECOMBI...

DAP-seq技術在R2R3-MYB轉錄因子LmMYB15調控金銀花分子機制研究中的應用2023/11/15

綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Loniceramacranthoides，別稱：金銀花)最重要的活性藥物成分，在醫學領域對天然CGA的需求急劇增長。雖然CGA生物合成的關鍵基因已有報道，但其轉錄調控機...