甲型流感為急性呼吸道傳染病，其病原體是一種新型的甲型H1N1流感病毒，在人群中傳播。自2009年開始，甲型H1N1流感在范圍內(nèi)大規(guī)模流行。2010年8月，世衛(wèi)組織宣布甲型H1N1流感大流行期已經(jīng)結(jié)束。2012年我國(guó)甲型H1N1流感病例超過(guò)300例，由于流感病毒經(jīng)常發(fā)生抗原漂移，因此經(jīng)常發(fā)生規(guī)模大小不等的暴發(fā)流行。

*動(dòng)物研究所何宏軒研究員領(lǐng)導(dǎo)的野生動(dòng)物疫病研究組2009年在《科學(xué)通報(bào)》上發(fā)表了甲型H1N1北美毒株特征（Chinese Sci Bull， 2009），證明了甲型H1N1流感的變異和進(jìn)化，對(duì)于人類呈現(xiàn)高親和力、低致病性、不具有高致病性流感病毒的特性、對(duì)神經(jīng)氨酸酶抑制劑類藥物敏感，但對(duì)金剛烷胺類藥物具有抗性等4大特征。近期又對(duì)甲型流感爆發(fā)以來(lái)H1N1病毒所有片段進(jìn)行了選擇壓力分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)除NS片段外其余7個(gè)片段的編碼區(qū)都呈現(xiàn)明顯的負(fù)選擇壓力，表明它們對(duì)人是比較適應(yīng)的。

NS片段是流感病毒的zui小片段，其編碼NS1和NS2兩個(gè)蛋白，分析發(fā)現(xiàn)NS1片段也呈現(xiàn)負(fù)選擇壓力，而NS2片段則在流感剛剛爆發(fā)的4月呈現(xiàn)出明顯的正選擇壓力，因此認(rèn)為NS片段極有可能在以前感染人H1N1病毒中從未出現(xiàn)過(guò)，在2009H1N1病毒中出現(xiàn)對(duì)于甲型流感進(jìn)入人體并導(dǎo)致疫情爆發(fā)可能具有一定的作用，而另一個(gè)不同尋常之處在于2009年8月的病毒NS2片段再次表現(xiàn)出明顯的正選擇壓力，這與一般的病毒跨宿主傳播的遺傳進(jìn)化理論不符。對(duì)于這一奇怪現(xiàn)象，認(rèn)為這與7月份以后甲流病毒傳播速度和傳播范圍的急速擴(kuò)大有關(guān)系，病毒接觸到的群體數(shù)量、群體多樣性都大為增加，因此病毒在進(jìn)化過(guò)程中再一次受到了正選擇壓力，進(jìn)一步表明NS片段是2009年前后重組到人流感病毒基因組的可能性。

綜上所述，認(rèn)為NS片段是這次甲型流感暴發(fā)過(guò)程中的一個(gè)極為特殊的片段，很有可能對(duì)甲流爆發(fā)以及蔓延起到了重要的作用。這一研究結(jié)果發(fā)表在PLoS ONE雜志上。該項(xiàng)目獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金，中科院知識(shí)創(chuàng)新工程等項(xiàng)目的支持。

NS片段的遺傳突變網(wǎng)絡(luò)分析，甲型流感病毒自4月份出現(xiàn)以來(lái)，就以兩個(gè)基礎(chǔ)的突變型（G1型，123V 和G2型，123 I）為原點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)化，這個(gè)變異的位點(diǎn)處于NS1的編碼區(qū)。出現(xiàn)這一現(xiàn)象有兩種可能，一是在病毒zui初傳播到人宿主時(shí)就是以兩個(gè)突變型的形式先后傳入的，該突變可能在甲流未傳入人的時(shí)候就已經(jīng)出現(xiàn)，因?yàn)檫@兩個(gè)基本突變性出現(xiàn)的時(shí)間都非常早，同時(shí)又分別都有大量的感染群體和后期進(jìn)化毒株的出現(xiàn)；二是病毒先以G1或G2中的一種進(jìn)入人體，而后另外一種由原始突變型進(jìn)化而來(lái)，但顯然該位點(diǎn)的突變使病毒獲得了明顯的感染傳播優(yōu)勢(shì)，在短期內(nèi)形成了龐大感染群體。